菲利普·豪斯卡 週一在 WWDC 2016 開發者大會上的演講持續了兩個小時，但蘋果遠遠未能提及它（而且不僅僅是）為開發者準備的所有消息。同時，即將到來的創新之一確實至關重要——蘋果打算用自己的解決方案取代相當過時的檔案系統HFS+，稱為蘋果檔案系統(APFS)，並將用於其所有產品。
與已經存在了數十年的各種變體的 HFS+ 相比，新的 Apple 檔案系統完全是從頭開始重建的，主要為支援 TRIM 操作的 SSD 和快閃記憶體帶來最佳化。此外，它還將為用戶提供更安全的資料加密（並且本身無需使用 FileVault）或更有效的資料檔案保護，以防作業系統崩潰。
APFS 還處理所謂的包含大塊零字節的稀疏文件，最大的變化是區分大小寫，因為雖然 HFS+ 文件系統區分大小寫，這可能會在 OS X 或現在的 macOS 期間導致問題， Apple 文件系統將消除敏感性。然而，蘋果表示，情況並非如此，正如其新系統尚無法在可啟動光碟和 Fusion Drive 光碟上運作一樣。
否則，蘋果希望在其所有設備中使用這個新的檔案系統，從 Mac Pro 到最小的 Watch。
與 HFS+ 相比，時間戳記也發生了變化。 APFS 現在有一個奈秒參數，這比舊的 HFS+ 檔案系統的秒數有了顯著的改進。 AFPS 的另一個重要功能是“空間共享”，它消除了磁碟上各個分割區固定大小的需要。一方面，它們將能夠在不需要重新格式化的情況下進行更改，同時，同一分割區將能夠共用多個檔案系統。
支援使用快照進行備份或還原以及更好地克隆檔案和目錄也將是用戶的關鍵功能。
Apple 檔案系統目前提供開發者版本 新推出的 macOS Sierra，但由於缺乏Time Machine、Fusion Drive或FileVault支持，暫時無法完整使用。在啟動磁碟上使用它的選項也遺失了。所有這些都應該在明年解決，屆時 APFS 顯然將正式向普通用戶提供。
